Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rai1Q61818 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rai1Q61818 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rai1Q61818 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rai1Q61818 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rai1Q61818 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rai1Q61818 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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