Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga6Q61739 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms