Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd2Q61285 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms