Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms