Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ncor1Q60974 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ncor1Q60974 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms