Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp7Q60973 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp7Q60973 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms