Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd4Q60688 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms