Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Satb1Q60611 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Satb1Q60611 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms