Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5bQ60519 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms