Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y5T2

Zdhhc18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc18Q5Y5T2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zdhhc18Q5Y5T2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zdhhc18Q5Y5T2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms