Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uimc1Q5U5Q9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uimc1Q5U5Q9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms