Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsr1Q5SWD9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms