Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms