Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RilpQ5ND29 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms