Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Odf3bQ5M8M2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms