Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps41Q5KU39 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms