Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms