Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Spag9Q58A65 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spag9Q58A65 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms