Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire1Q52KF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms