Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pdp2Q504M2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdp2Q504M2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Pdp2Q504M2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdp2Q504M2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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