Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3aQ4TU90 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms