Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem171Q4KL18 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms