Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms