Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Carmil2Q3V3V9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Carmil2Q3V3V9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms