Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs2Q3V3Q7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs2Q3V3Q7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pacs2Q3V3Q7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs2Q3V3Q7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Pacs2Q3V3Q7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Pacs2Q3V3Q7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pacs2Q3V3Q7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacs2Q3V3Q7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pacs2Q3V3Q7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms