Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms