Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms