Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms