Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf223Q3UV31 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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