Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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BB287469Q3UT53 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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