Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6899Q3USS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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