Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms