Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms