Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms