Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms