Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b2Q3UJB0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms