Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms