Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrrc58Q3UGP9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc58Q3UGP9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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