Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtulinQ3UCV8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtulinQ3UCV8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms