Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LbrQ3U9G9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms