Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3r6Q3U6Q4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms