Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Fam117bQ3U3E2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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