Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rnf40Q3U319 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf40Q3U319 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf40Q3U319 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rnf40Q3U319 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms