Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rnf149Q3U2C5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf149Q3U2C5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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