Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Serac1Q3U213 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms