Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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