Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc136Q3TVA9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms