Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp39Q3TIX9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp39Q3TIX9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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