Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc13Q3TIR1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms