Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M3Q31093 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M3Q31093 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms